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中山大學腫瘤防治中心擁有腫瘤醫學協同創新中心腫瘤精準診療臨床研究中心兩大平臺,是下列科研機構的依托單位:

 

序號

平臺級別

批準部門

成立時間

機構名稱

英文譯名

1

國家級

科技部

2005

華南腫瘤學國家重點實驗室

State Key Laboratory of Oncology in South China

2

國家級

科技部、國家食品藥品監督管理局

2001

國家新藥(抗腫瘤藥物)臨床試驗研究中心

National Clinical Study Center for Anticancer Drugs

3

國家級

教育部

2018

腫瘤醫學省部共建協同創新中心

Collaborative Innovation Center for Cancer Medicine

4

省部級

教育部

2003

腫瘤相關基因與抗腫瘤藥物研究教育部重點實驗室

MOE Key Laboratory of Cancer-related Genes and Anticancer drug

5

省部級

廣東省科技廳

1999

廣東省鼻咽癌診治重點實驗室

 Guangdong Key Laboratory of Nasopharyngeal Carcinoma Diagnosis and Therapy

6

省部級

廣東省科技廳

2009

廣東省國際科技合作基地中山大學腫瘤防治中心

Guangdong International Cooperation Base for Cancer Prevention and Treatment (Sun Yat-sen University Cancer Center)

7

省部級

廣東省科技廳

2015

華南腫瘤學國際合作基地

South China International Cooperation Base of Oncology

8

省部級

廣東省科技廳

2015

廣東省腫瘤精準治療分子靶點檢測工程技術研究中心

Guangdong Engineering Center for Precision Cancer Medicine and Molecular Target Testing

9

省部級

廣東省科技廳

2016

廣東省腫瘤精準醫學工程技術研究中心

Guangdong Engineering Center for Precision Cancer Medicine

10

省部級

廣東省科技廳

2018

廣東省腫瘤免疫與疫苗工程技術研究中心

Guangdong Engineering Center for Cancer Immunity and Vaccinations

11

地市級

廣州市科技局

2012

廣州市鼻咽癌多學科臨床診治重點實驗室

Guangzhou Key Laboratory of Nasopharyngeal Carcinoma Multidisciplinary Clinical Diagnosis and Therapy

12

校級

中山大學

2009

中山大學肝癌研究所

Liver Cancer Institute of Sun Yat-sen University

13

校級

中山大學

2003

中山大學肺癌研究中心

Lung Cancer Research Center of Sun Yat-sen University

 

 

中心對外開放的科研技術服務平臺:

一、高通量測序與基因分型平臺   
   
中山大學腫瘤防治中心高通量測序與基因分型平臺(高通量組學平臺),由精準醫學領域專家和具有豐富經驗的技術團隊,利用前沿技術方案,為廣大用戶提供優質可靠、臨床級、個性化的高通量測序及基因分型、數據獲取和數據分析服務。

    硬件設施 --萬級標準潔凈度PCR室,擁有高通量測序系統(HiSeq)、單細胞測序系統(10X Genomics、Split-Seq),高通量基因分型系統(iScan)及千核PB級計算機集群(IBM),并不斷更新。

    軟件設施 – 由多年承擔國家重大項目的精準醫學專家團隊領銜,技術團隊包括完成超過3萬例基因組數據分析骨干,相關論文在NEJM、Nat Genet、Lancet Oncol等高水平雜志多次發表。為項目設計和實施提供個體化咨詢、建議等服務。

    本平臺能夠處理包括外周血、組織、蠟塊、痰液等生物樣本來源核酸;能夠完成包括全基因組、外顯子組、轉錄組(RNA)、單細胞轉錄組或基因組及ATAC(表觀遺傳)測序等不同類型的測序服務和基因分型服務,并可針對不同個性化需求提供專業和針對性的建議和服務(目標區域捕獲、TMB、甲基化、基因組結構等);可應用于包括惡性腫瘤等復雜疾病的遺傳學、突變、基因表達等方面的組學研究,篩選疾病精準分型、精確診斷和精準治療相關的分子標志物或者靶點。

    可提供樣本提取處理、文庫構建、高通量測序以及數據分析等服務。用戶可依據需求選擇部分或全套項目。并可針對不同個性化需求提供專業和針對性的建議和服務。

平臺聯系人:流程問題請咨詢魏老師,電話15622103069,郵箱weipp@sysucc.org.cn;

技術問題請咨詢劉老師,電話13510731282,郵箱liuyux1@sysucc.org.cn;

項目設計請咨詢貝教授,電話020-87343189,郵箱beijx@sysucc.org.cn。

 

二、動物核素影像實驗室平臺

    中山大學腫瘤防治中心動物核素影像實驗室成立于2014年7月,目前擁有一臺Albira PET/CT及配套的氣體麻醉裝置、小鼠IVC籠架、潔凈工作臺、分裝熱室、活度計等。平臺依托我中心核醫學科,能為廣大用戶提供常用正電子顯像藥物及小動物活體PET/CT多模態分子顯像。

    小動物活體PET/CT多模態分子顯像可同時實現解剖形態學顯像和功能學顯像,以探索腫瘤等重大疾病機理研究、早期診斷和有效治療的新方法和新技術,探索分子成像技術向臨床應用轉化的可行性,促進分子影像轉化醫學的研究和應用。

    Albira PET/CT能同時對4只小鼠進行CT、PET/CT動靜態顯像,用戶可依據需要選擇不同的正電子顯像藥物或自行合成藥物對小鼠注射顯像,設備自帶PMOD數據后處理軟件,包括PBAS、PKIN、PFUS、P3D四個模塊,能滿足圖像融合、數據分析、圖像3D顯示等需求。

平臺咨詢時間:星期一至五上午8:00~12:00,下午2:30~5:30。

平臺辦公電話:020-87342382

平臺咨詢聯系人:張老師,聯系電話:020-87342199。


三、生物信息學平臺
  為我院科研和臨床提供醫學信息及生物信息數據分析服務。目前可提供的服務包括基因芯片數據處理、質譜數據分析、二代測序數據處理以及相關醫學統計建模等服務。
  平臺提供各類數據的生物信息學分析服務,分析內容包括以下部分(分析物種為小鼠、大鼠、疾病相關微生物/病毒、人類):蛋白質譜數據分析、蛋白修飾組學數據分析、蛋白芯片數據分析、高通量蛋白篩選結果分析、基因芯片數據分析、二代測序數據分析、高通量測序數據相關醫學統計建模、個性化圖形繪制等。
平臺聯系人:劉老師,電話8734252,郵箱:
liuzx@sysucc.org.cn

四、生物醫學統計分析平臺

    隨著科研人員對臨床研究課題的設計及統計分析相關的服務需求越來越大,中心生物醫學統計分析平臺為臨床醫生提供多項統計學服務:1. 統計咨詢:對各類統計設計及分析問題進行咨詢,不涉及統計分析及其他內容;2. 課題合作:雙方簽訂統計合作協議,協助國家、省部級、校級及院級等各類課題申報,參與課題方案設計、樣本量計算、隨機化及盲法、研究方案及統計調整、統計分析、結果解釋,提供統計方面的技術支持。

臨床研究設計與統計相關的咨詢服務內容包括:

1)臨床研究方案設計相關的咨詢,包括觀察性研究、干預性研究、診斷性試驗等。

2)樣本量估算相關的咨詢,主要是臨床試驗研究的樣本量計算。

3)數據庫設計相關的咨詢。

4)隨機化分組,包括隨機對照試驗隨機化分組方案的制定及隨機數字表的生成等。

5)統計分析方案相關的咨詢,包括統計分析方法的選擇及其結果解釋等。

6)論文發表過程中的統計問題咨詢。  

統計平臺咨詢時間:星期一、三、四下午2:30-5:30。

統計平臺咨詢電話:李老師,電話:020-87343553;郭老師,電話:87343050。

統計咨詢地點:1號樓8樓842,項目合作方式由雙方具體商定。

 

五、醫學大數據平臺
  醫學大數據平臺主要從兩方面開展工作。一、做好大數據與醫學研究的橋梁,利用大數據和大數據技術為醫學研究提供數據認知、數據檢索、數據處理等方面的大數據應用服務;二、做好信息技術與醫學研究的橋梁,利用大數據、云計算、移動互聯網、物聯網等技術為醫學研究提供信息化支撐設計服務。
  平臺提供多項服務:1.數據檢索服務:根據需求提供檢索建議,并利用計算機技術提供數據檢索、去隱私化、數據導出等服務;2.數據處理服務:根據需求提供多源數據關聯、數據結構化、數據格式重整等數據處理服務;3.數據分析服務:提供神經網絡、支持向量機、決策樹等常見機器學習算法的應用支持;提供數據的可視化探索支持;提供R語言等軟件包的編程指導和應用環境設置指導;4.科研信息化咨詢服務:提供健康人群篩查、數據的自動化采集、單病種數據庫建設、實驗室管理、標本庫管理、隨訪管理等醫學研究支撐信息系統的設計咨詢服務;提供醫院臨床大數據在科研系統建設中的應用咨詢服務。

  平臺聯系人:李老師,電話:87343588-609,郵箱:
lichf@sysucc.org.cn



中心工作基礎和實驗條件 

  中山大學腫瘤學科為國家重點學科,中山大學腫瘤防治中心是華南腫瘤學國家重點實驗室、教育部腫瘤醫學省部共建協同創新中心、腫瘤相關基因與抗腫瘤藥物研究教育部重點實驗室、廣東省鼻咽癌診治研究重點實驗室的依托單位。中心被認定為國家藥物臨床試驗機構?,F有10928平方米的現代化實驗室,建立了包括腫瘤資源庫平臺、腫瘤代謝組學平臺、腫瘤基因組學平臺、腫瘤蛋白組學平臺、生物芯片平臺、動物實驗平臺、分子影像學平臺、腫瘤干細胞分選技術平臺等八個功能應用平臺。良好的實驗設備與實驗條件支撐了本中心在分子醫學、腫瘤學、免疫學、藥理學、分子生物學及細胞生物學等多個學科的高水平發展?! ?span>

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